同年九月，林贤会同总兵何应元乘胜追剿郑军。林贤等率兵驾驶轻快双篷船直抵三沙、风火门、沙埕港等地，追剿那里的郑军。在林贤等指挥下，守备陈应昌在福宁三沙、风火门与郑军激战，擒获宿镇下参将王亮、游击朱尚、都司朱相等；守备陈大捷、何春立、周谢显在风火门遭遇郑军，郑军骁翼营将林兴率杨自名等献出大量刀枪、旗帜等投降；守备陈春晖、把总吴玉、林发在沙埕等岛遭遇郑军宿营副总兵陈起万等，陈春晖等奋命拼杀，焚烧陈起万坐船1只、赶缯双篷舶9只，郑军官兵溺水者不计其数；同知陈子威在沙埕遭遇郑军水师战船20余艘，经过战斗，擒郑军水师三镇林日惠标下副将林麟，缴获赶缯船1只，大炮3门，铜百子炮3门方。此外，陈子威督率乡勇直抵三都、长腰、白马门、濑屿等处，剿灭郑军吴朝纲和林十巢穴，得获伪镇萧琛营下小赶缯船1只，杀敌数十，活擒敌3名。可见，在康熙十七年（1678年）的战役中，林贤率领的水师所向披靡，战无不胜，战功显著，充分表现了他熟练的水战指挥才能。