事平之后，吴鲁痛定思痛，向当局提出：“时局阽危，宜切究我国三十年来之积弊，参考东西各国用人练兵筹粮之机宜。”先后撰论10篇，提倡改革。清光绪二十九年（1903年）八月，吴鲁出任云南学政，在云南广筹经费，遍立学校。次年回京，云南人为立德政碑于林则徐去思碑之右。

　　清光绪三十二年（1906年），吴鲁往日本考察后任吉林提学使，一年多时间开设了小学、中学、女子、师范、方言、实业、法政等学校。他每日视察一校，亲自向学生讲经济、讲兵法。当时，刚从俄国人手中接受下来的吉林考棚又被日本人占据，巡抚朱家宝及交涉司不敢过问，吴鲁上呈北京学部、外交部与其交涉，并移书日本文部交涉甚力，以至引起当道不悦，把他调回北京，闲置多时，才派他任国家图书馆总校。不久，辛亥革命爆发，吴鲁出京旅居浙江普陀山白华庵，次年二月回到故乡晋江，八月病逝于家。民国初年，吴鲁第四子吴钟善以其父遗稿编成《正气研斋文集》4卷、《诗集》1卷和杂录、杂著各2卷出版。由于历史的原因，这位爱国诗人、书法家、教育家长期以来没有得到应有的正面评价。

　　吴鲁在清光绪年间建造的3座五开间大厝，坐东北朝西南，成一字排列，门口铺着广阔的石埕，埕角立着一对旗杆座，上立1米多高的旗杆夹石。原先读书人中举登科都要竖立旗杆，高挂旗帜，标榜荣耀。据说原来吴鲁故居前竖有两对旗杆，一对是吴鲁状元的，八角旗座，旗杆夹上雕刻龙凤；一对是吴鲁之子、高中经济特科的吴钟善的，四角旗座，旗杆夹上雕刻着麒麟。吴鲁故居占地面积2050平方米，建筑面积1450平方米，配上这些高耸的旗杆，非常气派。

　　                                                                            （来源：晋江胜迹）