晋江市疾病预防控制中心是2005年4月经晋江市人民政府批准设立的公益性事业单位，前身为晋江市卫生防疫站，位于晋江市青阳街道洪宅垵社区120号。

中心人员编制220人，占地面积11483平方米，总建筑面积21041.6平方米，其中实验室面积7390平方米。现有各类仪器设备952台（件），其中50万元以上仪器设备18台。于1998年通过实验室资质认证（计量认证），2012年通过食品检验机构资质认定；被省卫健委确认为艾滋病确证实验室，具备消毒效果评价能力。2020年1月23日对首例疑似病例进行采样和检测，成为全省首家开展新冠病毒核酸检测县级疾控中心。 

晋江市疾病预防控制中心长期致力于保障辖区公共卫生安全，各项工作取得了显著的成效，得到各级党委、政府的充分肯定和群众的广泛认同 。